Psychiatrie en genetica

Genetische databasestop

• Autism Chromosome Rearrangement Database
  

  Een database van The Centre for Applied Genomics, Canada met bekende structurele genomische varianten (bijv deleties, duplicaties, translocaties) die gevonden zijn in autistische patienten. U kunt hier bijvoorbeeld nagaan of een bepaalde genetische variant bij een patient al eerder is beschreven. 

• Database of Genomic Variants
  

  Ook een database van The Centre for Applied Genomics, Canada. In deze database vindt u een overzicht van alle beschreven structurele varianten (deleties, duplicaties etc) in gezonde controles.

• HAPMAP
  

  Deze site geeft een up-to-date overzicht van de gekende variatie in het menselijk genoom, nodig voor het opzetten van genetische associatiestudies. In maart 2007 bevatte deze databank 3839354 "single nucleotide polymorphisms" (SNPs). U kunt per gen of per chromosomale regio opzoeken welke SNPs er gekend zijn. Verder kunt u ook bepalen hoe deze SNPs georganiseerd zijn in haplotypes, en welke SNPs essentieel zijn om de verschillende haplotypes die in de populatie voorkomen van elkaar te onderscheiden (zogenaamde haplotype tagging SNPs).

• Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
  

  Deze online database geeft mooie overzichtsinformatie over genetisch research. U kunt zoeken per ziektebeeld, maar ook per gen of per chromosomale regio. Wanneer u bijvoorbeeld per gen zoekt, krijgt u een samenhangend verhaal over de ontdekking van het gen, de relevante studies met betrekking tot ziektbeelden die met dit gen verband houden, de gekende polymorfismen in het gen, en zo verder. De databank wordt zeer regelmatig bijgewerkt.

• SchizophreniaGene
  

  In de rubriek SGene van de website van het Schizophrenia Research Forum worden meta-analyses gepresenteerd van elke gen / genetische variant waarvan associatie studies zijn gepubliceerd. De uitkomsten worden regelmatig bijgewerkt aan de hand van de meest recente studies en de zoekfunctie is is zeer toegankelijk opgezet.

• Software genetische analyses
  

  De programma's die worden gebruikt om genetische data te analyseren zijn constant in evolutie. Deze site geeft een uitgebreid overzicht van bestaande programma's, met telkens een korte uitleg en een link waar u het betreffende programma kunt downloaden.

• USCS Human Genome Browser
  

  Een genome browser geeft, zoals de naam suggereert, de mogelijkheid om het menselijk genoom te browsen. U kunt o.a. een specifiek gen opzoeken of op een specifieke locatie bekijken welke genen er liggen. De uitgebreide reeks aan "tracks" geven de mogelijkheid om een keur aan aanvullende informatie op te zoeken, zoals bijvoorbeeld de expressie van het gen in het brein of de evolutionaire conservatie van het gen.

• Wat zijn structurele genomische varianten
  

  Deze site van Tokyo Medical University biedt door middel van kleine clipjes eenvoudige uitleg over structurele genomische variatie.

Referentiestop